阴道菌群失调有自行恢复的可能，因为人体有防御系统，而且女性每个月有经血的冲刷作用，能够起到一定的自洁作用。发生菌群失调时身体状态好，随着每月月经的冲刷，可以将病菌冲刷、正常菌增生，所以能够恢复正常。需要保持健康的生活方式、减少性生活、适当地阴部护理，能够促使阴道菌群自行恢复。
除自行恢复外，也可以采取措施促进阴道菌群的恢复，可以用醋水冲洗阴道，即食用白醋兑白开水来冲洗外阴和阴道，使阴道保持酸性环境。酸性环境有利于菌群恢复，能够改变菌群失调，同时也可以适当人为添加部分阴道的正常菌，也能促进菌群失调的恢复。
