细菌性感染和病毒性感染都是临床上感染性疾病非常常见的类型，甚至有些医生都不是能够很好的区分细菌性感染和病毒性感染，但是区分这两种疾病又极其重要，因为细菌性感染往往用抗菌素治疗，病毒性感染不用抗菌素治疗，如果不应该用抗菌素，用大量抗菌素会导致抗菌素耐药，所以区别细菌性感染和病毒性感染很重要。
细菌的感染部位比较明确，而且主要在感染地方引起疾病损害，比如呼吸系统感染引起细菌性肺炎，主要是咳嗽、咳痰，主要是引起肺部感染，其它系统很少受累。泌尿系统感染会出现尿疼、尿急、尿频、尿里有大量白细胞、细菌，往往是细菌感染。病毒性感染，比如临床常见的上呼吸道感染，像感冒、流感、普通腹泻，多数都是病毒感染，系统可能不是很清楚，比如病人又发烧，又可能会出现拉肚子，还有可能会出现咳嗽，感染系统可能不像细菌局限性。
