对于牙龈囊肿，要根据囊肿的部位、面积和大小而决定相应不同的治疗方案。针对面积较小的牙龈囊肿，密切观察并且找到导致原因。

1、牙龈炎、牙周炎或食物嵌塞：只要将牙菌斑、牙结石及牙齿周围的炎症去除，牙龈囊肿就可以得以改善。如通过全口洁治、龈上洁治和龈下刮治，并且给予漱口液漱口。另外可以给予相应的药物涂抹。如果以上方法都不能解决牙龈囊肿，可能要考虑采取手术的方法解决。建议患者尽早到正规医院的口腔科或口腔医院口腔颌面外科，找医生进行仔细的检查、评估、拍片、分析等，将囊肿进行切除后再进行病理分析检查，决定进一步的治疗方案；

2、牙髓炎或根尖周炎：多半考虑进行患牙根管治疗术，从根本上解决牙龈囊肿的问题。