喉咙不舒服对核酸检测理论上不会有太大的影响，但是喉咙不舒服可能使被检测人员不配合医生大夫的操作，导致采样的失败，或者采集到的样本不合格，可能影响核酸检测的结果。
目前新型冠状病毒感染的诊断，主要以咽拭子或者鼻拭子的核酸检测作为诊断的金标准。采用咽拭子检查时，如果正好喉咙不舒服，采集标本的过程中，可能增加喉部不适的症状，甚至可以出现恶心、呕吐等。在采集标本的时候，被检测的人员则可能不配合医生的操作，出现躲避的情况。此时采集到的标本质量可能得不到保证，影响检测结果，从而出现假阴性的情况。
因此如果出现喉部不舒服，特别是已经出现喉部红肿比较明显的时候，可以换用鼻拭子的方法进行采样，更有助于保证核酸检测的准确率。
