腰疼、便意频繁的原因有多种，主要如下：

1、结直肠疾病：包括直肠、乙状结肠附近的炎症，因为尤其是乙状结肠，位置比较靠后，炎症、肿瘤或者其他疾病，都可以引起不适。因为此处靠近脊柱，所以可能误以为是腰疼。另外直肠和乙状结肠如果有病变，可以刺激导致便意频繁；

2、阑尾炎：如果是化脓性阑尾炎，阑尾的脓性分泌物向外分泌，因为人直立情况下，盆腔位置较低，所以分泌物堆积在盆腔，刺激患者出现便意，但是每次排便不多，并且有排便不尽的感觉。同时因为有阑尾的炎症，可以有腰部的酸痛情况；

3、妇科疾病：卵巢是在盆腔内，如果存在炎症刺激，同理炎性分泌物堆积在直肠附近，刺激产生便意、排便不尽的感觉，同时还有腰背的酸疼。

总而言之，如果出现腰疼、便意频繁，而且持续时间相对较长，超过3-5天，要及时就诊，避免耽误病情。