脑血栓喝水呛，主要是以治疗原发病为主，治疗措施有以下几点：

1、抗栓治疗：脑血栓形成引起的建议进行抗栓治疗。在溶栓的时间窗之内，特别是在6小时之内进行溶栓治疗。可以加用神经细胞保护剂，如胞磷胆碱钠、依达拉奉来进行治疗，合并使用可以保护线粒体功能、开放侧支循环的丁苯酞等治疗急性期原发病，能解决喝水呛咳的症状和改善症状；

2、康复治疗：如果经过积极的药物治疗，原发病仍然没有完全康复，建议可以使用康复治疗，特别是吞咽的康复训练，有专门的康复医生进行指导训练；

3、鼻饲治疗：如果经过康复训练、用药，仍然不能够完全解决喝水呛咳的问题，建议应用鼻饲治疗。可以从胃管内注入食物，特别是液态的食物、营养剂等，解决喝水呛咳，避免出现呛咳而引起的肺部感染。