牙根下囊肿可能是根尖囊肿、 角化囊肿，或者是成釉细胞瘤表现为囊肿样。主要根据影像学判断，但金标准是病理检查，需根据具体病因来对因治疗，具体情况如下：
1、根尖囊肿或角化囊肿：可以做根管治疗，在手术时尽量保留患病牙齿。在根管治疗做完后，牙齿根尖可以截根，也可以磨，前提是根管治疗做掉；
2、成釉细胞瘤：长在囊腔中的牙在手术时可能需要拔掉。
无论时何种原因引起的根尖下囊肿性病变，都应该及时处理。对于小的根尖周炎，可以观察根管治疗后是否会自行吸收。而对于比较大的根尖周炎，则需要考虑手术。患者早期可能不痛，外形改变较小，但后期可能会使脸一边大、一边小，并且急性感染后，可能因急性发作引起疼痛。
