膀胱镜检查最常用的体位是截石位，平躺在检查床上，两条腿放在专门的床架两边脚踏上，保持双下肢的扩张外展体位。方便进行经尿道外口置入膀胱内窥镜，对膀胱内病变进行初步判断和分析，还可以在膀胱镜下做基本的简单操作。
临床上膀胱镜主要用于对血尿的病因分析和判断，了解患者尿道有没有狭窄、肿瘤，膀胱部位有没有新生物。如果有，可以在膀胱镜直视下取活检送病理，对病变性质进行病理学的分析和确诊，为后期治疗进行很重要的参考提供依据。
除此而外，膀胱镜检还可以做简单操作，如膀胱镜下异物取出，或膀胱镜下输尿管插管，可能会缓解肾脏积水，保护肾脏功能。另外还可以对上尿路结石病人提供很好的输尿管扩张的准备工作，为后期手术碎石提供很便利的条件。
