附睾囊肿的微创手术，通常需要采用腰麻或全麻方式进行，但部分医院会采用局麻方式，与医院条件有关。腰麻或全麻患者术中不会有疼痛感，手术会更加平稳、安全，局麻可以进行，但需要患者较好配合，因为局部麻醉患者可能会感觉到牵拉甚至疼痛，术中需要随时追加麻药，与手术医生麻醉技巧均有较大关系。
多数男性存在附睾囊肿，若囊肿比较小通常不需要进行手术，也不会对男性造成影响。如果囊肿较大或引起不适症状，常见于中老年人，可能会要求进行附睾囊肿手术。但附睾囊肿也不一定要行微创手术，直接将囊肿剥除即可。对于没有结婚及生育的年轻人，不建议进行附睾囊肿手术，因附睾囊肿手术可能会损伤附睾，有可能会导致附睾梗阻，影响将来生育能力。
