急性肾盂肾炎的治疗，主要针对引起急性肾盂肾炎的致病菌，分别选用敏感抗生素进行治疗，常见致病菌包括：
1、大肠埃希菌，即大肠杆菌；
2、克雷伯杆菌；
3、绿脓杆菌；
4、少数情况下还可以见到金黄色葡萄球菌、草绿色链球菌以及表皮葡萄球菌等。
因此对于急性肾盂肾炎的患者，除做尿常规、血常规检查外，最好能够做清洁中段尿培养，明确致病菌，再选用敏感抗生素进行治疗，药物如下：
1、头孢类抗生素：主要针对大肠杆菌感染，如头孢西丁、头孢曲松、头孢他啶、头孢哌酮；
2、喹诺酮类抗生素：常用左氧氟沙星、莫西沙星；
3、糖肽类抗生素：如果是金黄色葡萄球菌引起的急性肾盂肾炎，需要选用万古霉素进行针对性抗感染治疗。
