治疗复杂性热惊厥应先控制体温，再根据具体病因进行治疗，具体措施如下：
一、控制体温：不能等到体温＞38.5°C才吃退烧药，在出现发热症状时及时给予退热治疗，可以口服布洛芬类或对乙酰氨基酚类退烧药。如果口服药物困难或伴有频繁呕吐，不能够口服药时可以选择布洛芬栓或对乙酰氨基酚栓；
二、对因治疗：寻找导致孩子发热的原因，可以查血常规、C反应蛋白。1、如果是细菌感染，需要及时给予抗生素进行治疗。2、如果是病毒感染，需要给予抗病毒药物治疗，在短期内迅速将炎症控制住，使体温恢复正常。3、如果抽搐次数较频繁或在一段时间内频繁出现热惊厥发作，这时需要在短期内应用儿童常用的抗癫痫药物治疗，如丙戊酸钠，属于广谱的抗癫痫药物。
复杂性热惊厥易形成癫痫，所以要积极控制发作的频率，同时在症状恢复后定期复查脑电图来进行监测。
