黄杆菌肺炎治疗原则为选择合适抗生素进行抗感染治疗，重症患者应注意支持治疗。一般治疗包括病期应该饮食清淡、热量充足、富含蛋白质及维生素、易消化，避免进食刺激性食物。恢复期可正常饮食，注意个人卫生，防止其它感染，应注意休息、保证充足睡眠，利于恢复。适当运动提高身体素质，保持心情舒畅。如果出现呼吸困难者，可给予吸氧等辅助通气。
黄杆菌肺炎治疗主要为抗生素治疗，菌株对米诺环素、氧氟沙星敏感，大多数菌株对舒巴坦或头孢哌酮敏感。部分菌株对万古霉素、克林霉素和氯霉素敏感，部分耐药菌株对阿米卡星敏感，可以根据药敏试验及时调整用药。
