引起手指关节疼痛的原因有很多，根据不同的年龄，以及是否有伴随症状和手指关节疼痛的数量，原因也会有所不同，主要有以下几点：

1、腱鞘炎：最为常见的引起单个手指关节，尤其是拇指关节疼痛的原因为腱鞘炎。通常情况下，患者在翘大拇指的时候会有疼痛，甚至伴随着腕关节的疼痛。

2、关节炎：如果中年女性或者老年女性，出现手指多个关节的疼痛，还伴随着早晨起床的时候手指关节的僵硬，甚至变形的情况，可能是退行性骨关节炎和类风湿关节炎导致。如果手指关节疼痛还伴随着僵硬，且僵硬的时间持续在30分钟以上，甚至一上午手指都僵硬，到了下午的时候才灵活，伴随着关节的疼痛、肿胀，此时往往提示有类风湿关节炎。

但如果手指关节僵硬，只在早晨起床一瞬间，10-20分钟，不超过半小时，伴随着手指关节的疼痛，则多见于骨性关节炎，也就是手指小关节的骨性关节炎。除了根据僵硬的时间，患者还可以通过抽血化验检查血沉、C反应蛋白、类风湿因子、抗CCP等指标是否有异常，如果是骨关节炎，上述指标均正常，如果是类风湿关节炎，则上述指标就会出现异常。

3、颈椎病：如果有2-3个手指关节的疼痛，伴随着颈部的疼痛和手指关节的麻木，此时还要排除是否存在颈椎病压迫神经所引起的手指关节疼痛。

此外，痛风急性发作，也可以引起手指关节的疼痛。具体是何种原因，可能还需要由医生来做综合判断。