决定肾病综合征预后最关键的因素是肾脏病变的病理类型。儿童而言最常见的病理类型是微小病变型的肾病，微小病变型肾病在临床上表现为激素敏感型的肾病综合征，单用激素的治疗效果非常理想，通常可以治愈。
如果在治疗的过程中，遇到激素依赖的或者是激素抵抗型的肾病综合征，往往会建议病人尽早的完善肾穿刺活检术，尽早的明确病理类型。
因为有一些的病理类型，如膜增生性的肾小球肾炎、膜性肾病、局灶节段性肾小球硬化、IgA肾病等这些病理类型，单用激素可能解决不了问题。要在激素的基础上，联合免疫抑制剂，尽可能的、尽早的去控制蛋白尿，延缓这些儿童的慢性肾脏病变的恶化进展，尽可能的去保存肾功能，达到早期治愈的目标。
