生理性子宫附件囊肿可随着卵子、卵泡液排出而消失，病理性囊肿可持续存在，甚至逐渐增大，建议手术切除。
一般囊肿绝大多数都是存在于附件，比如卵巢囊肿、输卵管系膜囊肿，单纯的子宫囊肿比较少见。子宫囊肿大多数是子宫肌瘤液化的表现，B超下显示成囊性，实际上是一种子宫肌瘤的良性变化。多见的卵巢囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿。生理性的囊肿大多数在月经排卵期之前，卵泡逐渐长大，在排卵之前做B超的时候可能会发现1-2cm的卵巢囊肿。随着排卵的卵子排出、卵泡液排出，生理性囊肿也会消失。
病理性囊肿首要表现为囊肿持续存在，甚至慢慢增大，可以是良性子宫卵巢浆液性的囊腺瘤、子宫内膜异位症囊肿，俗称巧克力囊肿。这一类的病理性的疾病还是建议手术切除。还有一种良性疾病，即输卵管的系膜囊肿，输卵管系膜囊肿随着囊肿逐渐增大，也建议手术切除。
