附件囊肿的消除方法包括手术治疗和药物治疗，具体如下：

1、手术治疗：若是病理性囊肿的情况下，比如卵巢局部出现的囊肿，如巧克力囊肿、浆液性囊肿、黏液性囊肿等。上述病理性囊肿通常在直径达到一定程度时，需要手术才可消除，不做手术的情况下不可能消除。因此，没有手术指征就建议定期检查，然后临床上每0.5年做1次B超检查；若有手术指征就建议尽快考虑进行手术治疗。此外，附件囊肿也可能是指输卵管局部的积液或积脓，上述情况通过B超检查都会发现附件区有囊肿。但上述情况用药物治疗效果不好的情况下，病人临床症状又特别明显，也可考虑进行手术治疗，比如切除患侧的输卵管从而达到治愈的目的，在手术后仍需要用抗生素进行治疗，并且也要加强营养才能使身体尽快康复；

2、药物治疗：输卵管局部的积液或积脓通过B超检查会发现附件区有囊肿。此类情况通常在临床需要用抗生素进行治疗，而且用抗生素的量要足、时间要够长，才可能使局部的积水或积脓治愈。