病毒性结膜炎是病毒感染引起，细菌性结膜炎以细菌感染引起，这两个结膜炎的本质上有区别。一个是病原体不一样，一个是表现也应该有区别。细菌性的结膜炎以脓性的分泌物为主，分泌物就像黄色的脓一样，主要是由于中性粒细胞吞噬病原体造成的脓细胞引起。
病毒性的结膜炎主要以水样黏稠的分泌物为主，是水一样的分泌物。而且有的人病毒性结膜炎，会联合耳朵边上、耳后的淋巴结有肿大，但是细菌性结膜炎一般不会有这种情况。
而且病毒性结膜炎和细菌性结膜炎都是可以见于感冒之后，并不是感冒以后就一定是病毒性或者一定是细菌性。病毒性感冒可以引起细菌性的结膜炎，也可以引起病毒性的结膜炎。
如果是病毒性结膜炎，一般用阿昔洛韦滴眼液，如果是细菌性结膜炎，一般用左氧氟沙星滴眼液或者妥布霉素滴眼液。这两种结膜炎都要注意休息，这样才可能好的快一点。
