病毒性角膜炎主要是抗病毒类的药物，目前这类药物的品种还不是太多，比如阿昔洛韦或者更昔洛韦的眼用凝胶。同时也有角膜上皮修复支持和营养的药，比如玻璃酸钠、贝复舒(重组牛碱性成纤维细胞生长因子滴眼液)。

如果病毒性角膜炎是内皮性或者角膜基质性，角膜的上皮完整时也可以适当用些激素的眼药水。这种激素的眼药水主要是抗炎和去水肿，一定要在医生的监护下使用，还可以点滴保护性药物和干扰素的眼药水。

病毒性角膜炎对眼睛的损害是反复发作的特点，可能这一段时间好了，过一段时间又发作了，病情迁延不愈。所以需要长期使身体机能保持很壮、很好的状态，来抵御病毒再复发。同时用药的时间也比较长一点，比如无环鸟苷或者干扰素的眼药水点的时间稍微要长一些。

发生比较严重的病毒性角膜炎时也可以适当口服抗病毒药物，也能够起到治疗病毒性角膜炎的作用。经过这些综合的加强身体抵抗力、加强口服的抗病毒药、加强局部眼睛点药，一般情况下经过数个月的治疗，病毒性角膜炎都能够得到有效的控制和治好。