肾结石碎石需要用药，常用的肾结石碎石方法有体外冲击波碎石取石术、经皮肾镜碎石术、输尿管镜碎石术。无论采用哪种治疗方法，在碎石前后都会给患者口服或静脉应用抗生素。
因为无论是哪种治疗都可能会对肾和输尿管局部造成轻微损伤，术前和术后采用一段时间的抗感染治疗，可以最大限度地避免结石粉碎过程中继发泌尿系统感染。除此之外，在将结石打碎后部分结石仍然难以排出，常需要给予患者配合口服的排石中药或排石药，来帮助排出结石。
临床可采用清热利湿、通淋的中药或者中成药，常用的中成药有排石颗粒、尿石通丸等，中草药有金钱草、海金沙、石韦、瞿麦等，这些药物本身具有清热利湿的作用。现代研究证实这些药物可以增加人体尿液的生成，有促进输尿管蠕动的作用，可促进排出结石。
