判断肿瘤恶性度的高低有较多依据，最主要的依据是肿瘤的分化程度。通常肿瘤按照分化程度分为高分化肿瘤、中分化肿瘤以及低分化肿瘤，还包括未分化肿瘤，通常高分化肿瘤恶性程度较低，未分化肿瘤恶性度较高。

有些病理类型也提示肿瘤恶性度较高，比如肺癌在临床上按病理类型，分为腺癌、鳞癌以及小细胞肺癌，小细胞肺癌相比肺腺癌和鳞癌恶性度较高。此外，乳腺癌的免疫组化也帮助判断恶性度的高低，比如三阴乳腺癌的恶性度较高，通常患者发现肿瘤时，多数为晚期，临床上有效的手段较少，肿瘤长得较快，此肿瘤就认为属于高度恶性肿瘤。