脾囊肿最好的治疗办法就是做部分的脾切除，囊肿也切除了，脾脏的功能也保留了。但是对于较小的脾囊肿，不主张做手术，而是主张观察。
一般＜5cm的脾囊肿，密切观察就行了，隔半年到1年做个B超，甚至是CT，看囊肿是否有长大。如果长得较快，或者是超过5cm，建议做手术切除。
因为超过5cm的脾囊肿或者长得比较快的脾囊肿，有时不能完全排除是良性或恶性，所以这时做手术较好。
在做手术的情况下，则要看囊肿的部位。如果囊肿正好在上级或者下级，做手术就可以选择囊肿加上上级的脾切除，或者囊肿加上下级的脾切除，既保留了部分的脾脏，手术后脾脏的功能也没有受到损伤，可以发挥正常的脾脏功能。
如果脾囊肿正好在脾底的地方，就是正好在脾脏血管比较丰富的地方，有时做脾脏囊肿的部分脾切除比较困难。在特殊情况下，为了判定囊肿到底是良性，还是恶性，或者囊肿较大，对脾脏影响很大，也可以做脾切除。
