治疗宝宝鹅口疮时，要明确鹅口疮是由于白色念珠菌感染所引起，属于真菌感染。由于只发生在口腔局部，所以只需要局部涂抹外用药物就可以。药物一般选择制霉素片，可以将制霉素片碾碎，用温水化开。溶解之后，涂抹在鹅口疮的部位，建议1天涂抹3次。
除了使用制霉素片以外，还可以使用碳酸氢钠溶液，因为白色念珠菌是在酸性环境下或者中性环境下生长，在碱性的环境下不能够正常生长。所以碳酸氢钠溶液，对于白色念珠菌也有一定的杀灭和抑制作用。
同时也要对宝宝所有接触的奶具、奶瓶、杯子进行杀菌、消毒处理，建议每天用消毒柜消毒或者用开水煮10分钟。白色念珠菌感染跟免疫功能低下也有一定的关系，要注意适当地提高宝宝的免疫力。
此外也要注意，还有一部分宝宝的鹅口疮是由于长期使用抗生素导致，则需要及时调整抗生素或者停止使用抗生素。
