肾病综合征的治疗是由患者的肾脏病理分型来决定，这也就是为什么患者一旦确诊肾病综合征，医生常常建议进行肾穿刺活检的原因。肾病综合征主要分为5大种病理类型，微小病变型、细膜增生型、细膜毛细血管型、膜性，以及局灶节段型。
微小病变常见于青少年，它们对激素的药效比较敏感，但也容易复发。细膜增生、细膜毛细血管，以及局灶节段型，它们需要使用激素及免疫抑制剂，例如环磷酰胺、霉酚酸酯类的药物，咪唑立宾片等来进行联合的药物治疗。
而膜性肾病常见于中老年人，随着全球大气污染的加重，年轻患者的比例也越来越高，膜性肾病也需要使用激素加免疫制剂的联合治疗，特别是环磷酰胺，或者是钙调磷酸酶抑制剂。
除了传统的激素加免疫制剂的治疗外，近期兴起了生物制剂，包括利妥昔单抗等，它们对于微小病变型、膜性肾病的肾病综合征患者有较好的效果，它们对于微小病变型和膜性肾病患者也有很好的疗效。
