睡眠呼吸暂停综合征的治疗，首先可以给予常规治疗，因为最主要的原因是肥胖，可以通过减重、运动，同时可以选择侧睡，侧位睡眠的时候，舌体后坠就会好转。应避免服用安眠药、镇静药，并且不要饮酒、抽烟等。如果患有鼻中隔偏曲、鼻息肉，或者有扁桃体、腺样体肥大患者，需要到耳鼻喉科进行治疗。
如果没有病理性问题，最经典的治疗是无创呼吸机治疗，根据检测现在的无创呼吸机治疗，可以选择的机型很多，比如单水平、双水平，或者是单水平自动、双水平自动。需要根据检测的压力滴定结果，选择使用呼吸机、治疗模式和治疗压力。部分患者也可以使用口器，常用于比较轻度的患者。个别的患者可以手术治疗，通过五官科的微创手术，或者是开放性的手术，也可以在口腔科进行手术。
