轻度缺氧做核磁共振检查不出来，核磁共振主要是反映脑组织形态学或功能变化，但由于轻度缺氧，往往通过血氧饱和度的测定进行测定进行检查。当有严重缺氧，比如窒息、溺水、一氧化碳中毒、新生儿缺血缺氧性脑病，血液里氧含量降低非常明显时，在脑内才能反映出来。因为脑组织有自我保护功能，如果发生缺氧，会把身体内更多的氧、更多的血供应到脑皮层和脑干等生命中枢，保证生命中枢的氧和血的供应。

对于比较严重的脑供血不足，核磁共振能反映出来，在脑部会有缺血灶、梗死灶。因为缺血以后慢慢发生了坏死，患者会发生脑梗死，甚至还有脑组织萎缩，这是由于脑供血不足、脑供血减少所引起的情况，但轻度缺氧核磁共振检查不出来。但是如果由于脑动脉狭窄、脑动脉闭塞引起脑供血不足，做磁共振血管成像也可以反映出来，可以看到哪支血管狭窄。这支血管供应的脑组织里会发生缺血、梗死改变，包括灌注成像，也可以发现比较明显的脑血流量减少、脑血流量不足的定量资料，但是轻度缺氧做磁共振无法检查。