患者肠道菌群失调时，通常建议其补充益生菌，常见的益生菌有以下几种：
1、定植菌：包括常用的双歧杆菌、乳酸杆菌等，通常直接补充此类细菌，可以调节肠道菌群；
2、过路菌：如地衣芽孢杆菌、枯草杆菌等，此类细菌并不长期定植在肠道，而属于过路菌。通过补充过路菌，可以维持患者肠道的正常环境，从而有利于有利菌生长，从而起到调节作用。
对于肠道菌群失衡的患者，尤其是菌群变化比较明显的患者，不当的抗生素使用是引起其的主要原因。如果是由于抗生素所导致的肠道菌群失调而引起的腹泻，通常将其称为抗生素相关性腹泻，也可能是伪膜性肠炎。对于病情比较轻的患者，补充益生菌往往有效，但对于重症患者，单独补充益生菌可能不够，可能需要针对难辨梭菌进行治疗，包括用甲硝唑或万古霉素进行治疗，才能有效缓解症状。
