脑干梗塞的典型症状在临床称为交叉瘫，一侧的颅神经麻痹合并对侧肢体瘫痪。根据脑干梗塞不同的部位，中脑、桥脑、延髓出现不同的交叉瘫表现，具体如下：
1、累及支配眼球运动的神经：会出现眼球运动障碍，眼球向某个方向运动会受限，同时出现复视，看东西出现重影；
2、累及面神经：会出现面瘫，此种面瘫和面神经炎的面瘫表现类似，一侧眼睛闭不严、鼻唇沟变浅；
3、累及咽喉部控制吞咽的肌肉：会出现呛咳，喝水或者吃东西时咽不下，会出现剧烈咳嗽；
4、在延髓部位累及三叉神经：可出现一侧面部和对侧的肢体躯干部麻木。
除了以上局灶性体征，脑干梗塞还可能会出现明显头晕的症状。面积较大、病情严重者还会出现意识障碍，病人轻则表现为嗜睡，重则可以出现昏迷。脑干梗塞在临床中属于比较危险的梗塞类型。
