EB病毒感染在人体最常见的感染途径是口口感染，EB病毒从口腔进入人体，先在咽部的淋巴组织中繁殖，再进入体内淋巴组织中进一步繁殖导致人体发病。人体感染EB病毒通常为隐性感染，自身不会产生异常感觉，由于病毒在体内繁殖，人体会出现EB病毒抗体，在化验抗体时会发现感染过EB病毒。

部分患者感染EB病毒后，会出现咽喉疼痛，称为咽峡炎，同时伴有发热、淋巴结肿大、肝功能异常、肝脾肿大，以及皮疹等表现，称传染性单核细胞增多症，这种情况也是EB病毒感染，属于自限性过程，在对人体造成损伤后，病毒会被人体清，绝大部分患者会痊愈。极少数患者感染EB病毒后，呈现为慢性感染过程，EB病毒此时在人体停留时间超过半年，同时导致人体出现反复发热、淋巴结肿大、肝功能异常时，此时称慢性EB病毒感染。慢性EB病毒感染可能与血液疾病有关，包括淋巴瘤、嗜血细胞综合征等，慢性EB病毒感染通常治疗难度比较大。