不同实验室补体C3的正常值并不完全一致，通常补体C3的高值在80-86mg/dL。补体C3升高时通常见于炎症性疾病，如类风湿关节炎、成人斯蒂尔病等，炎症状态有时可出现C3升高。

更有意义的为C3降低，最常见是系统性红斑狼疮患者在疾病活动期，通常出现补体下降。若治疗后患者病情稳定，补体可恢复至正常。其他因素可影响补体水平，如肝脏功能受损时，补体合成受到影响，出现补体降低。