肛周脓肿一旦诊断明确需要尽早手术，中医治疗在整个治疗环节中也能发挥的非常重要的作用。针对患者不同的辨证分型及疾病的阶段辨证施治，一般在未成脓阶段以消为主，通过清热解毒，软坚散结的药物使脓肿尽快消散。成脓阶段通过托的方法包括补托法、透托法，使脓液尽早排净，达到治疗作用。后期以补为主，通过补益气血，促进局部生肌，尽早愈合。
临床未成脓阶段就诊患者极少，一般门诊患者多数属于已经形成脓肿或脓肿破溃阶段，这类患者建议尽早手术治疗。通常手术包括单纯的切开引流和根治性的脓肿手术。对于位置比较低、表浅的肛周脓肿一般进行一次性根治手术，位置比较高的脓肿以切开引流，低位切开、高位挂线为主。
