通常生理海盐水洗鼻不会造成危害，注意做鼻腔冲洗的时候，避免太用力以及做吞咽动作。如果做吞咽动作，鼻部后端鼻咽部与中耳腔相通的咽鼓管会开放，咽喉管一旦开放做冲洗时候又用力，有可能将海盐水经过咽鼓管冲入到中耳腔，从而导致中耳炎，则会有耳痛、耳鸣、耳闷甚至听力下降的情况。
如果能避免此类情况，鼻腔冲洗可以经常做，主要作用是可以将鼻腔、鼻窦的分泌物尽量冲洗干净。可以减少过敏原与鼻腔黏膜接触，也可以减少病毒细菌与鼻腔鼻窦黏膜的接触与刺激，从而可以减轻过敏性鼻炎的症状，还可以减轻感染负荷。做鼻腔冲洗之后，保持鼻腔以及鼻窦黏膜清洁，再喷鼻腔的药物较好，药物可以与鼻腔鼻窦黏膜相结合，从而能够发挥较好的药效，对于治疗鼻炎更好的效果。
