病人在晨起时，出现心慌、气短、胸闷症状的原因如下：

1、晨起时是迷走神经兴奋占优，向交感兴奋占优转变的时间段。从夜间的休养、修复，到白天的兴奋，适合工作、活动的交替阶段，可以出现轻微的心率增快；

2、如果出现明显症状则为不正常现象，有可能是出现心律失常，比如早搏、心动过速等，可以通过24小时的心电图，排查是否并发心律失常；

3、原发的心脏疾病，可能会在早晨出现加重，比如冠心病等。当晚上迷走神经兴奋时，心率减慢、心肌耗氧减少，症状比较轻或没有症状。当早晨交感神经兴奋之后，心率增快，交感神经心肌耗氧增加，可能会出现胸闷、胸痛症状。此时要及时就诊，排查是否为原发的基础疾病加重或新发的冠心病；

4、有的病人有心功能不全的情况，早晨交感神经兴奋、心率增快等失代偿情况下，也可以出现呼吸困难气短，要及时就诊。排查是否存在原来的心脏病、基础疾病加重，及时调整治疗。