幽门螺杆菌呼气试验检测需要空腹，因为幽门螺杆菌检测呼气试验的原理，是先让病人空腹，最好不刷牙，先吹一口气，这口气会标明，称为底气袋。之后吃一粒尿素，尿素含有碳13或碳14同位素的碳，进入胃窦以后，如果有幽门螺杆菌感染，则会产生尿素酶。尿素酶会将尿素分解，变成氨和二氧化碳，二氧化碳随着血液循环进入肺，0.5小时以后再次呼气，这一袋气称为样气袋。
将底气和样气放到仪器进行检测，看看前后同位素碳的浓度，得出准确数值，如碳13正常值是0-4dpm，而碳14正常值是0-100dpm，这样能够衡量感染的严重程度。如果进食以后，会将胃窦附近的尿素酶粘液冲洗掉，检测结果会偏低，甚至是假阴性。因此医生会强调做幽门螺杆菌检测时，呼气试验一定要空腹。如果是白天，通常要空腹6小时以上，也可以进行。
