呼吸系统的功能非常强大，通气和换气是呼吸系统最主要功能。通气主要与外界大气之间的空气交换过程。换气主要以肺泡中与人体毛细血管中的氧气吸收交换的过程，除呼吸功能外，常见还有以下几种重要功能：
1、代谢功能：如人体组织、活性氧的部分代谢。呼吸系统具有重要代谢功能，如果其中出现问题，会引起某些严重炎症反应；
2、神经内分泌功能：肺内某些细胞，如嗜银细胞细胞一样具有内分泌的功能，可产生相应内分泌介质，如某些细胞异常可引起男性分泌乳汁、血钙增高等异常；
3、防御功能：如通过鼻毛等机械屏障，黏膜分泌性免疫球蛋白防御外来的微生物、巨噬细胞和主动吞噬功能等。
