小儿嗜血细胞综合征是较危重的疾病，部分小儿可以治愈。小儿嗜血细胞综合征在临床上又分为两类，一类为原发性嗜血细胞综合征，大多是由于遗传因素导致基因变异而出现嗜血细胞综合征。另外一类为继发性嗜血细胞综合征，大多继发于病毒感染、免疫系统疾病及肿瘤。
对于遗传性或原发性嗜血细胞综合征，通常需要经过造血干细胞移植，才能最终达到治愈和缓解的目的。继发性嗜血细胞综合征主要针对原发疾病，如果是病毒感染所引起，需要积极控制病毒感染。如果是由于免疫系统疾病所引起，则需要积极治疗免疫系统疾病，通常可以取得较好的效果。另外嗜血细胞综合征一半的小儿，可以得到治愈。
