二价宫颈癌疫苗只是预防高危型HPV16和18两种，四价宫颈癌疫苗除预防HPV16和18两种高危型之外，还包括HPV6和11两种低危型，即针对四个病毒，两个高危和两个低危，四价宫颈癌疫苗除能预防70%以上的宫颈癌之外，还可以预防生殖道、肛周、口腔尖锐湿疣发生。

二价宫颈癌疫苗适用年龄范围更广，9岁可以接种，45岁以后不必接种，四价宫颈癌疫苗跨度可能是20-45岁。这两种疫苗接种的时间，都要接种三次，二价宫颈癌疫苗是在注射之后第一个月和第六个月再接种，四价宫颈癌疫苗在首次接种之后的第二个月和第六个月再接种，都是三次，只是第二次注射的时间不同。