萎缩性外阴白斑最常见的治疗方法是阴道上药。这种情况需要观察是绝经期，还是非绝经期，可以补充营养类药物，改善外阴白斑的溃疡，如果合并感染，也需要治疗炎症。若有明显的雌激素下降，除有子宫内膜和乳腺疾病的情况下，可以用雌激素软膏，或者是雌激素进行阴道上药，达到黏膜吸收治疗的目的。所以在允许的情况下，也需要局部上药。
如果有明显的外阴白斑病变时，需要进行阴道活检，排除癌前病变以及外阴炎症。因为部分患者营养不良后，会引起部分黏膜和组织萎缩，如果并非癌前病变和癌症，还可以长期使用雌激素。也可以用超声刺激以及盆腔的盆底功能治疗仪，可使局部血管增生、切除病灶，改善局部黏膜的血液供应以及营养状况。
如果是反复的萎缩性外阴白斑，需要观察是否会引起阴道挛缩，包括外阴挛缩，有时外阴粘连的情况会影响正常排尿或者性生活，可能需要手术的干预治疗。因此，明显的萎缩性外阴白斑应及时前往专科医院，在妇科医生的指导下，判断是否外阴上药或者是手术治疗。
