AMH主要用于评估卵巢储备功能，反映卵巢中剩余卵子的数量，经常用于评估不孕症以及试管婴儿前的卵巢储备功能，以此为根据选择适合的助孕技术。在性激素六项，有一项称为卵泡刺激素，即FSH，如果该指标大于12U/L，也认为是卵巢储备功能不良的相关指标。如果卵泡刺激素FSH大于25U/L，即需考虑卵巢早衰的风险。
但是性激素六项除FSH外，还有黄体生成素LH、泌乳素、雌激素、孕酮和睾酮，主要反映女性内分泌激素的总体变化，在评估月经是否异常、月经是否紊乱，以及不孕的原因中发挥着重要作用。因此，AMH和性激素六项并不能完全互相替代。
