丙肝病毒基因分型一般分为六种，分别为基因1型、基因2型、基因3型、基因4型、基因5型、基因6型，每个基因型又可以分为若干亚型，一般用a、b、c表示，如基因1a型、1b型、2a型、2b型等。不同地区基因型分布存在一定差异，我国最常见的基因型是基因1b型，占50%以上，其次是2a型，约占1/4，再其次是基因3型和基因6型，在吸毒人群中比较常见，而基因4型和5型在我国较罕见。
基因分型与抗病毒治疗药物和治疗方案有关，抗病毒药物分为基因特异型和泛基因型两大类。基因特异型主要是针对基因1型和4型，泛基因型可针对所有基因型，两大类药物疗效均较好，但价格存在较大差异。因此，一般在治疗前都要进行基因型检测，以选择合适的药物。
