矮小症的诊断标准是指小于身高的3百分位或者是小于负的2个SD，可以根据以下两种方法进行判断：

1，身高体重百分位表：有一个身高的表就是中国的0-18岁儿童的身高体重百分位数表，百分位数表里面就有3百分位、10百分位、25百分位、50百分位、75百分位、90百分位或者97百分位。在此等级当中，如果小于3百分位，就称为矮小。3百分位就指的是成年男性的身高长不到1米6，成年女孩子的身高长不到1米5的部分孩子；

2、标准差：即均值的标准差，就是负的1个SD、负的2个SD、负的3个SD。如果低于负的2个SD，也称为矮小。其实在负的2个SD以下，对应身高百分位数表，其实比身高百分位数表要求更严格。其实是相当于小于负的2.8个SD，就称为矮小。