肠镜进行活检并不一定是癌症，需要进行活检的情况较多，如肠黏膜上出现异常隆起，包括息肉样变化、腺瘤样变化，可能是良性疾病，并不是癌症，所以患者不要因为肠镜活检就考虑是癌症。在临床上肠镜作为常规的消化系统肿瘤的筛查方式，特别是对大肠癌的早期筛查起着至关重要的作用。
相比于其他腹部CT来讲，肠镜能够更清晰地发现肠道黏膜变化，可能是炎症性变化、溃疡性变化、增生性变化，如果发现上述问题可能也要进行活检，进一步判断。如果是良性病变可以在镜下进行对症治疗，多数患者可以达到治愈。如果镜检为癌症，需要进一步结合病理情况、分期，决定后续的治疗策略，规范性治疗，即使是癌症生存期也会进一步延长。
