过敏性鼻窦炎的治疗临床多采用综合治疗，包括抗组胺药物、中成药物、抗生素，鼻用糖皮质激素等。过敏性鼻窦炎常常因过敏性鼻炎反复发作而导致，同时由于过敏性鼻炎、鼻窦炎是由IgE介导的机体Ⅰ型变态反应。
因此常有明显的季节性，如春秋季多见。但因为过敏原不同，所以部分患者属于常年性鼻炎、鼻窦炎，没有明显的季节性，可表现为鼻痒、打喷嚏、流清涕。而在继发细菌感染后，还可能会出现流脓涕、头疼等症状，检查可发现鼻腔黏膜水肿、鼻甲肿大，或鼻腔可以有清水样分泌物、黏脓性分泌物。
治疗需给予抗组胺药物，如氯雷他定、西替利嗪等，并配合中成药物，如苍耳子鼻炎胶囊、香菊胶囊、鼻渊通窍颗粒等。局部用药包括布地奈德、糠酸莫米松等，以缓解鼻腔黏膜的水肿。另外，随着目前免疫治疗的应用，针对过敏性鼻窦炎的患者，还可通过做脱敏治疗来取得较好的临床效果。
