扁桃体发炎会咳嗽，包括急性扁桃体炎、慢性扁桃体炎等，具体如下：
1、急性扁桃体炎：病人除了会咳嗽以外，同时会高热39-40℃，且伴有咽痛非常剧烈的情况，影响进食、影响喝水，还会伴有咽堵。由于有脓性的分泌物刺激咽喉，进而会导致病人伴有咳嗽，此时通常会给予抗生素的静脉给药，或者口服头孢类、阿奇霉素类、青霉素类、喹诺酮类的抗生素。局部要给予含片、漱口水、治疗咽喉炎的中成药进行治疗，病人通常在1周到10天左右，症状会逐步缓解以至痊愈；
2、慢性扁桃体炎：慢性化脓性扁桃体炎的病人也会有咳嗽症状，通常是由于炎症刺激所导致，病人还会有咽干、咽痒、异物感、烧灼感等不适症状。如果慢性扁桃体炎反复的发作，通常会采取手术切除的方式进行治疗。随着慢性扁桃体炎的治愈，通常咽部的异物感、咳嗽、咽痒、烧灼感等症状，都会明显的缓解或痊愈。
