癌症来源于人体上皮细胞的一种恶性肿瘤，相当于上皮细胞恶变，恶变以后，这种肿瘤就称为癌。多数的癌如腺癌、鳞癌是最常见的癌症类型，通常癌症都是来源于上皮组织，上皮组织的肿瘤可以很多种，如肺癌、胃癌、乳腺癌、结直肠癌等部位上皮组织发生恶变引起。
而间质瘤是另外一种组织学类型来源的肿瘤，这种来源的肿瘤主要来源于间叶组织，多数的间质瘤都出现在胃肠道，胃肠道的间质瘤在临床中发病率还是比较低，不是一种常见的肿瘤。肿瘤的良恶性程度取决于肿瘤细胞的性质，临床中多数间质瘤都是恶性肿瘤，少量间质瘤是良性肿瘤。但是肿瘤的良恶性，要根据肿瘤发生的部位、性质、侵犯邻近组织的程度，以及手术后细胞分析核分裂象，用以判断肿瘤的类型是偏于良性还是偏于恶性。所以间质瘤不是癌症，但是间质瘤大多数是一种恶性肿瘤。
