贝那普利和依那普利主要的区别在于药物持续长短和循证医学证据方面不一样，具体如下：
1、药物持续长短：贝那普利是长效的药物，而依那普利持续的时间较短，叫中效的药物。贝那普利管24小时，所以叫长效药物。依那普利管的时间短，比如吃了以后7-8个小时就不再起作用了，需要吃第二片来起作用；
2、循证医学证据：从医生的角度，贝那普利和依那普利的循证医学证据不一样，虽然是同一类的药物，都是血管紧张素酶转换酶抑制剂，叫ACEI或者普利类的药物。但是不同厂家生产，在研发的过程中化学特点不太一样。在做临床试验的时候，经过不同病人群的验证，普利类的药物主要用来治高血压、心衰。在治疗心衰和治疗高血压的时候，会做临床试验。比如贝那普利做的临床试验主要集中在高血压领域，而依那普利的临床试验在心衰领域。所以在应用的时候，医生可能心里有数。但实际上二者同时都是又可以治疗高血压，又可以治疗心衰。
所以两者都是很不错的药物，没有本质上的区别，只有药物持续时间长短不一样的区别。
