包皮溃烂最常见的原因是包皮龟头炎，通常是包皮垢里的大肠杆菌、葡萄球菌感染导致皮肤溃烂、红肿。首选治疗浅表细菌感染的外用抗生素软膏，最常用的药物为百多邦或者红霉素软膏，应用后症状会有较好的改善。局部瘙痒比较重，可以加用炉甘石洗剂止痒。溃烂、渗出比较多，必要的时候可以用1∶3000高锰酸钾液浸泡包皮和龟头，切记配比浓度不宜过高，配比之后溶液为淡淡的粉色即可，否则容易烧伤龟头、包皮的皮肤，治疗起来更加困难。
治疗期间患者要注意外生殖器的卫生，每日淋浴、每天更换内裤、尽量选透气性好的内裤。如果患者同时有包皮过长或者包皮炎反复发作、包茎，一定尽早做包皮环切手术，否则容易复发。
