移植3天小腹隐隐作痛，常见原因如下：

1、取卵之后卵巢的局部刺激：取卵后的血液流到腹腔内，引起腹膜的部分反应，通常疼痛持续时间比较短，不是持续疼痛，疼痛程度也比较轻，此时可以继续观察；

2、情绪影响：比如情绪的高度紧张、焦虑，也可能会有小腹隐痛的感觉，建议患者放松心情，通过如看书、看电影等方式，分散自己的注意力；

3、子宫收缩：移植3天小腹隐隐作痛跟子宫的收缩也有关系，建议患者注意休息，继续使用黄体支持药物；

4、便秘、腹胀：患者移植之后可能活动量减少，以及黄体支持药物、孕酮的影响，会导致胃肠道的蠕动功能下降，从而引起便秘、腹胀，也会有小腹隐痛的感觉。此时患者可以考虑多吃容易消化的食物，多吃新鲜的蔬菜水果；

5、卵巢过度刺激综合征：部分患者可能是新鲜周期移植，可能会有卵巢过度刺激综合征的发生，导致小腹隐痛。此时如果程度不是很剧烈，建议可以多吃蛋白质含量比较高的食物，多喝电解质含量比较丰富的饮料，在一定程度上预防卵巢过度刺激综合征发生。

综上所述，移植3天小腹隐隐作痛的原因很多，患者可以考虑通过放松心情、注意休息、继续黄体支持，然后在饮食等生活方式上进行相应的调整、处理。