卵巢囊肿会导致痛经。子宫内膜异位囊肿也是卵巢囊肿的一种，典型的症状便是痛经，因此部分卵巢囊肿会造成痛经，但仅限于子宫内膜异位囊肿，其它单纯性卵巢囊肿、赘生性囊肿或皮样囊肿不会造成痛经。部分患者痛经的原因比较明确，比如有子宫内膜异位症、子宫腺肌症、子宫腺肌瘤，典型的症状是痛经，但部分患者单纯只是痛经，不存在卵巢囊肿等问题。
对于部分痛经比较剧烈的患者，建议去医院仔细做检查，明确是否合并有子宫内膜异位囊肿，如果确实合并有子宫内膜异位囊肿，可以通过手术的方法将卵巢囊肿剥除，或将可能造成疼痛的部位做活检，将异位灶清理掉。通过以上方法可以使部分痛经患者得到有效治疗，另外手术后再合并部分药物治疗，包括避孕药、GnRHa(促性腺激素释放激素类似物)类药物，可以使患者痛经的症状得到一定缓解。
