肚脐眼中间隐隐作痛通常考虑中间附近脏器的病变，具体如下：
1、小肠功能性病变：是最常见的一种情况，是由于自主神经功能紊乱引起肠功能紊乱，从而导致疼痛，这种疼痛是因为肠管功能异常，不再节律收缩，有时快速收缩会引起疼痛，有时几个小时不蠕动，也会造成胀痛，排除器质性疾病之后给予纠正肠功能的药物，再给予补充益生菌，纠正肠道菌群失调，会有不错效果；
2、小肠器质性病变：比如常见的小肠炎症性疾病，如克罗恩病、肠结核，还有非特异性肠炎，要通过消化道造影、小肠镜检查来进行明确诊断。
3、其他疾病：如横结肠的疾病及右半结肠，甚至阑尾的疾病，如阑尾肿瘤、慢性阑尾炎、回盲部肿瘤、横结肠肿瘤，也会表现出该处的隐隐作痛，结肠疾病可以通过CT和结肠镜检查来明确，还有的是肠系膜上肿瘤性的病变，如小肠间质瘤、系膜间质瘤等，或腹膜后器官的病变，需要通过腹部CT进行检查，如果有，需要给予规范化治疗。
