临床上，系统性红斑狼疮主要还是依据病人的临床表现、症状、体征，以及结合特异性化验室检查进行判断，比如病人出现皮肤红斑、关节痛，甚至出现蛋白尿或心包积液、浆膜腔积液、白细胞减少、血小板减少、溶血性贫血等多系统损害。
如果出现2-3条或4条上述症状，需去风湿免疫科进行化验检查。如果出现抗核抗体阳性或抗双链DNA阳性，甚至补体降低，则可综合诊断系统性红斑狼疮，但最终需依靠专科医生来进行诊断。
系统性红斑狼疮是风湿免疫科异质性比较高的慢性风湿免疫性疾病，可以累及全身多个系统。从关节、肌肉、皮肤等，到内脏系统，如肾脏、肺脏、心脏等，所以它诊断依据也非常复杂。
